Yazar "Özkan Koca, Ayça" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 3 / 3
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Yayın Patates Zararlısı Leptinotarsa decemlineata, Say (Coleoptera: Chrysomelidae) Populasyonlarının mtDNA (Sitokrom Oksidaz Alt ÜnitesiCOI+COII) & nDNA (Mikrosatellit) Karakterizasyonu ve İnsektisit Direnci İle İlişkili Asetilkolinesteraz 2 (AChE2) Genindeki Mutasyon Frekansı Farklılığı(2018) Kandemir, İrfan; Özkan Koca, AyçaPatates böceği [Leptinotarsa decemlineata, Say (Coleoptera: Chrysomelidae)] tarımda önemli bir böcek zararlısıdır. Ergin ve larvalar patates yaprakları üzerinde beslenmekte ve bitkiye zarar vermektedir. Bu önemli tarım zararlısı ile ilgili populasyon içi ve populasyonlar arası genetik varyasyonlar üzerine çalışmalar ve potansiyel direnç seviyeleri hakkında ayrıntılı araştırmalar oldukça azdır, ülkemizde ise hiç yoktur. Projedeki amacımız, farklı moleküler belirteçler (mtDNA ve nDNA) kullanılarak patates böceğinin Türkiye populasyonlarındaki genetik yapısını ortaya koymak, ayrıca Asetilkolinesteraz 2 (AChE2) geninin dizi analizini yaparak organofosfat direnci ile ilişkili mutasyonların sıklığının, genetik olarak potansiyel direnç seviyelerinin belirlenmesidir. Bu doğrultuda toplam 100 lokasyonda yapılan arazi çalışmaları sonucunda patates böcekleri toplanmıştır. Böceklerinin total nükleik asitleri izole edilmiş ve populasyon yapısını ortaya koymak üzere mitokondriyal DNA (Sitokrom Oksidaz Alt Ünitesi-COI+COII) bölgesi dizi analizi ve 11 mikrosatellit lokusunun fragment analizi yapılmıştır. Populasyonların potansiyel direnç seviyelerini anlamak için Asetilkolinesteraz 2 (AChE2) genindeki organofosfat direnç mutasyonlarının sıklığı kısmi baz dizi analizi ile belirlenmiştir. Sitokrom Oksidaz Alt Ünitesi-COI+COII gen bölgesinin dizi analizi sonuçları tek bir haplotipin (H1) varlığını göstermiştir. Avrupa'da yapılan analizlerde bu haplotipin tek haplotip olduğunu belirtmektedir. Bu gen bölgesi ABD'de 20 farklı haplotip ile temsil edilmekte, ancak Idaho eyaletinde Avrupa ve ülkemizde bulunan bu haplotipin (H1) fikse olduğu rapor edilmektedir. 11 mikrosatelit lokusu 100 lokasyonun her birinden 5 birey ile çalışılmıştır. Yapılan farklı analizler bölgeler bazında benzer sonuçlar göstermiştir. Doğu anadolu tek başına, TrakyaMarmara ve Ege birlikte grup oluştururken üçüncü grubun Karadeniz, İç Anadolu ve Akdeniz populasyonlarından oluştuğu gözlenmiştir. Ek olarak farklı bölge, il ya da lokasyonlarda özgü aleller bulunmuştur. Asetilkolinesteraz 2 (AChE2) gen bölgesi dizilenmesi sonucunda, toplam 88 farklı haplotip tespit edilmiştir. AChE2 bölgesi dizilerinde 2 non-sinonim (Y54H ve S291G) mutasyon tespit edilmiştir. Bu proje sonucunda ülkemizde patates zararlısı olan böceğin populasyon genetik yapısı ortaya konulmuş, farklı bölgelerde farklı direnç seviyeleri tespit edilmiştir. Ülkemizde bu böceğin genetik çeşitliliğinin yüksek düzeyde olduğu ve populasyonun genişleme aşamasında bulunduğu yapılan analizler ile belirlenmiştir.Yayın Türkiye Bal Arısı Populasyonlarında Ön Kanat Deformasyonları (Genişletilmiş Türkçe Özet makalenin sonunda verilmiştir)(2017) Eligül, Hakan; Özkan Koca, Ayça; Kandemir, İrfanBal arıları, (Apis mellifera) hemen hemen tüm bireylerde aynı damar oluşumunun genel bir modelini gösteren iki çift zararlı kanada sahiptir. Kanat hücrelerinin şekilleri ile birlikte kanat damarı oluşumu, bal arısı taksonomisi çalışmaları için morfometrik karakter olarak kullanılmıştır. Bununla birlikte, bu genel damar yapısına ek olarak, bilinmeyen nedenlerle bazı bireylerde, ekstra damar oluşumları, damar bağlantıları veyamevcut damarlarda belirli bir parça kaybı görülebilir. Bu çalışmada amacımız, Türkiye'nin farklı bölgelerindeki bal arısı populasyonlarının kanatlarında düzensiz damar anomalilerini araştırmaktır. Çalışmada Türkiye'de 23 ilden toplam 6681 işçi bal arısı kullanılmıştır. Anomalileri görselleştirmek için, işçi arı bireylerinin sol kanatları üzerindeki damarlarda yapısal farklılıklar fotoğraflanmıştır. Bal arısı örneklerinde, kanat damarlarında farklı tipte oluşumlar gözlenmiştir; Yeni damar oluşumları bağlantı noktaları veya eksik damarlar gibi. Toplam 13 farklı damar anomalisi tespit edilmiştir. En yaygın iki oluşum, sırasıyla marjinal hücrenin dış kenarında (oluşum 2) ve 2rs-m çapraz damarının dış yüzeyinin arka çeyreğinde (oluşum 1) meydana gelmiştir. 2rs-m çapraz damarının dış yüzeyinin arka çeyreğinde meydana gelen damar (oluşum 1) en yüksek Karadeniz Bölgesi bal arısı populasyonlarında görülmüştür. Ek olarak oluşan en yaygın damar (oluşum 2) ise Ege Bölgesi bal arısı populasyonlarında en yüksek oranda kaydedilmiştir. Kanat damarlanmasındaki diğer bozuklukların düşük oranda olduğu tespit edilmiştirYayın ÜLKEMİZDE GÜNEY MARMARA BÖLGESİ’NDEKİ BAL ARILARINDA NOSEMA CERANAE’NİN MİKROSKOBİK VE MOLEKÜLER OLARAK BELİRLENMESİ(2016) Kandemir, İrfan; Özkan Koca, Ayça; Azari Zanjani, Peiman; Seven Çakmak, Selvinar; Çakmak, İbrahimBu çalışmada Bursa ve Balıkesir çevresindeki kolonilerde mikroskobik olarak Nosema türlerinin varlığını belirlemek ve multipleks PCR yöntemi ile kolonilerin hangi Nosema türü (N. ceranae ve N. apis) ile enfekte olduğunu tespit etmek amaçlanmıştır. Mikroskobik inceleme sonucunda, 14 koloniden 11 tanesindeki (%78,6) bireylerde Nosema sporları bulunmuş ve taranan bireylerin Nosema ile enfekte olduğu tespit edilmiştir. Bu kolonilerden alınan örneklerde multipleks PCR metodu kullanılarak moleküler tanımlama ile N. ceranae'nın 16S rRNA gen bölgesini karakterize eden bantlar bulunmuştur. Çalışmada kolonilerin büyük çoğunluğunun N. ceranae ile enfekte olduğu tespit edilmiştir
